許多有毒的蘑菇長得和普通食用菌很像，通常的辨別方法是這樣的：

從生長地帶上看：毒蘑菇往往生長在陰暗、潮濕的骯臟地帶；無毒蘑菇多生長在清潔的草地或松樹、櫟樹上。

從顏色上看：毒蘑菇外觀大多色澤鮮艷美麗，特別是紫色的往往有劇毒，采摘后易變色，可謂越艷麗毒性越大。

從形狀上看：毒蘑菇蓋上有肉瘤，菌面厚實板硬，蘑菇柄上有蕈環、蕈托等，菌托桿細長或粗長，易折斷；無毒蘑菇蓋較平，傘面平滑，菌面上無輪，下部無菌托。

從分泌物上看：將采摘的新鮮野蘑菇撕斷菌株，有毒蘑菇的分泌物稠濃，呈赤褐色，撕斷后在空氣中易變色，將其放在銀器里煮時變為綠色或黑色；無毒蘑菇的分泌物清亮如水（個別為白色），菌面撕斷不變色。

從氣味上看：毒蘑菇有怪異味，如辛辣、酸澀、惡腥等味；無毒蘑菇有特殊香味。

不過，有專家提醒：以上這些識別方法并不是絕對靠譜!

請看以下舉例：部分色彩不艷、長相不好看的野生蘑菇也是有毒的，如灰色的灰花紋鵝膏、擬灰花紋鵝膏和白色的致命鵝膏就為劇毒種類;而雞油菌和一些顏色鮮艷的紅菇種類卻是美味的食用菌。

以“有無汁或斷面變色”來判斷蘑菇是否有毒，也不一定靠譜。如松乳菇、紅汁乳菇掰開或劃傷后會流出乳汁，但卻是美味的食用菌。一些可食用的牛肝菌斷面會變成藍色，也是可食的。

認為“生蛆或生蟲的蘑菇無毒”更是無稽之談。很多劇毒蘑菇成熟后也會生蛆或生蟲。如：致命鵝膏就會被蟲啃食。

還有傳說中的毒蘑菇與銀器、大蒜、大米或燈芯草同煮可致后者變色；毒蘑菇經高溫烹煮或與大蒜同煮后可去毒。這樣的說法都不科學。

疾控專家提醒，基本鑒別要點：“戴帽、穿裙、穿鞋”的野生蘑菇有毒，即“有菌蓋、菌環、菌托”的菇都不能吃。不過，這條標準讓很多可食蘑菇躺著也中槍。例如，常見食用菌中大球蓋菇有菌環、草菇有菌托、香菇有毛和鱗片。

醫生提醒市民，辨別毒蘑菇不能靠經驗，總之盡量不要食用野生蘑菇！萬一誤食了有毒蘑菇要立即采用急救措施，如催吐，并盡早到醫院就診，最好攜帶剩余蘑菇樣品，以備鑒定蘑菇的種類，有效救治。